L' Istituto fa capo alla Fondazione Istituto Leonardo da Vinci, costituita il 18 novembre 2005. La Fondazione ha lo scopo di sostenere e promuovere attivitá ed iniziative, in ambito formativo e culturale rivolte al settore scolastico, attraverso il proprio patrimonio ed i proventi derivanti da donazioni o da altri introiti. La Fondazione partecipa all'organizzazione ed ai costi diretti ed indiretti relativi all'Istituto Leonardo da Vinci, in Svizzera come all'estero. Gli organi della Fondazione sono: il Consiglio di Fondazione e l'Ufficio di Revisione